在澳洲大堡礁的深海中，小丑鱼爸爸玛林和儿子尼莫简单幸福的生活着，可是爸爸做事常常畏首畏尾，是个胆小鬼，尼莫觉得爸爸很不勇敢，甚至有点看不起自己的爸爸。小尼莫却天不怕地不怕，跟同伴们去水面玩耍的时候，竟然被渔网捞了起来，辗转被卖到一家牙医诊所。玛林对儿子的生死未卜感到十分的担忧，就算平时不能大胆行事，为了儿子也要勇敢豁出去了。可是在路上遇到了很多艰难与恐惧，令他十分胆怯。幸好他遇到了好心的多瑞，一路与他作伴。父子俩都遇到了很多热心的帮助，最终都能重逢，玛林也从此成为儿子以及大家心中的英雄。
影片改编自同名漫画，原著漫画讲述一个神秘的跟踪者名叫“缄默”，他似乎打算从远处暗杀蝙蝠侠。故事中有许多客串角色，其中包含了大量的蝙蝠侠反派，还有多位蝙蝠家族的成员以及和蝙蝠侠的老战友，超人。它还探索了蝙蝠侠和猫女之间的暧昧情愫。
