2006年の発売から根強い人気を誇るPlayStation2用ゲーム「ペルソナ3」をアニメーション映画化した「PERSONA3 THE MOVIE」の第3章。季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。
有人能让时间暂停,但是在这个静止的空间里他就会变成孤身一人;有人能看到十分钟后发生的事情,却因无人相信自己的话只能眼睁睁地看着惨剧发生;有人能逆转十秒的时间,为了救出死去的妻子和孩子他逆转了无数个十秒,反复目击无数次妻儿死去的一刹那,他精神崩溃了;有人能在梦中预知不久之后的未来,然而却不敢跟周围任何人提起。 这里的每个人都有调控短暂时间的特殊能力,他们都有属于自己的伤痛。然而,当这些人聚集在一起时却是一个惊心动魄的故事!