奥尔法兽事件过后，随着时间流逝，御台场地区也渐渐复兴著。 “回到日本之后，我就决定一定要去大大的澡堂泡澡！”因为美美这句话，加上为了欢迎新加入的伙伴芽心和缅因猫兽，大家前往附近的温泉主题公园。虽然度过了一段开心的时光，但是这儿并没有阿丈的身影。 面对高考临近的事实，他在高考和“被选召的孩子们”的使命之间产生了烦恼。“为什么又必须是我们去面对啊？” 这个时候，在御台场再度出现了感染的数码宝贝、这是拥有着高傲灵魂的奥加兽。而看着电视中奥加兽的暴走，美美和巴鲁兽决定出击。“必须要让人们知道，也有好的数码宝贝！” 然而，美美和巴鲁兽无视光子郎而参与的战斗，却造成了意想不到的结果。各自怀揣烦恼的阿丈与美美。在月岛综合高中文化祭当天，一个男人出现在了他们面前。 如今，冒险再度进化……
这部动画由吉卜力工作室与法国合资制作，主要讲述了男主因航船失事流落到了无人岛，存活下的男人企图建造救生筏逃离荒岛，但他的计划却不断被一只神秘的巨型红海龟破坏，在他绝望时，一名神秘女子出现了并挽救其灵魂的故事。
偶遇到神秘少年“海”（石桥阳彩配）和“空”（浦上晟周配）的这个炎炎夏天，是琉花（芦田爱菜配）暑期的正式开始。天真无邪的“海”，看透一切的“空”，海洋馆里发光的鱼群，对琉花来说都像是一场浪漫的约定如期而至。
