普通高中生四月一日君寻（福山润 配音），有着异于常人的体质，他可以看到并且吸引各种鬼怪，而如果和同学百目鬼静（中井和哉 配音）在一起时，就不会被鬼怪缠上。因为命运的牵引，四月一日走进了一家奇怪的店里，这是一家可以帮客人实现任何愿望的店，但是店主人壹原侑子（大原沙耶香 配音）同时要拿走和这愿望对等的代价。侑子答应帮四月一日实现远离鬼怪的愿望，而作为代价，四月一日要留在店里打工。 有一天，一个阴郁的少女走进店里，委托侑子实现自己的愿望。由此，侑子、四月一日和百目鬼三人来到了一所诡异的豪宅里。在这里，他们遇到一群奇奇怪怪的收藏家，同时，四月一日在这所大房子中遭遇了各种各样的灵异事件，犹如在仲夏夜里做了一场诡秘的梦…
早在多年前，有着优良传统的黑猩猩家族就成为人类派往太空执行特殊任务的代表。如今，作为黑猩猩家族的第三代传人，汉姆三世(安迪•萨姆伯格 配音)也顺理成章地被选作为继承家族优良传统的新一代太空飞行员。原因是，美国国家航空航天局NASA的价值59亿元之巨的航天探测器突然消失在浩瀚的银河之中。需要新一批训练有素的太空黑猩猩团队去调查此事。此番太空黑猩猩团队中除了汉姆三世之外，还有胆大心细的母猩猩露娜(切瑞•海恩斯 配音)，以及身体强壮的泰坦 (帕特里克•沃尔波顿 配音)。“三人”小组在NASA进行了一番艰苦且全面的训练之后，终于踏上了远征太空的神秘之旅……
堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，准备在落成之日举行演奏会。然而在演奏会之前，堂本音乐学院的学生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。 园子带着柯南一行人来听排练，认识了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有绝对音感的秋庭也开始遭遇到危险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。 然而就是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭排除在凶杀外。这边已经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时危在旦夕，绝对音感成为了唯一的救命线索。柯南找到了爆炸的逻辑，要在罪犯引爆最后一个炸弹前，把他找出来。
